Interpretable machine learning for diagnosis and prognosis in neurodegenerative disease
Looptijd: 2022-2026
Het onderzoek
Computermethoden kunnen artsen helpen een goede diagnose of prognose te maken bij dementie door te leren van gegevens, zoals MRI scans en andere testen, van eerdere patiënten.
Hoewel deze computermethoden zeer veelbelovend zijn, is het voor artsen niet altijd helemaal duidelijk waarom de computer voor een specifieke patiënt een specifiek oordeel geeft.
In dit project werken we aan geavanceerde methoden die de computermethoden beter interpreteerbaar maken voor artsen en patiënten.
Subsidiegever
- China Scholarship Council
Onderzoeksteam
- Wenjie Kang, promovendus BIGR
- Dr. Esther Bron, universitair docent BIGR
- Dr. Stefan Klein, universitair hoofddocent BIGR
Contact
Leden onderzoeksteam
Dr. Esther Bron
Universitair Docent
Specialisme Radiologie en Nucleaire Geneeskunde
Aandachtsgebied Hersenbeeldanalyse en machine learning
_______________________________________________________________________________
Opleiding en carrière » 2020-heden: Universitair docent, Radiologie & Nucleaire Geneeskunde, Erasmus MC Rotterdam
» 2016-2019: Postdoctoraal onderzoeker, Afdelingen Medische Informatica en Radiologie & Nucleaire Geneeskunde, Erasmus MC Rotterdam
» 2015: Visiting researcher, Centre for Medical Imaging Computing, University College London, London, Verenigd Koninkrijk
» 2011-2016: Promotieonderzoek Medische beeldverwerking, Promotor: Prof. Wiro Niessen, Erasmus MC, Rotterdam
» 2009-2011: Master Medische Natuurwetenschappen – Medical Physics, Vrije Universiteit Amsterdam (cum laude)
» 2006-2009: Bachelor Medische Natuurwetenschappen, Vrije Universiteit Amsterdam
_______________________________________________________________________________
Onderwijsactiviteiten » Werkcollege Kritisch lezen van technisch wetenschappelijke literatuur, Bachelor 3e jaar, Klinische Technologie, TU Delft
_______________________________________________________________________________
Nevenfuncties » Erasmus MC Imaging Office
» Lid Management Board & Imaging Data manager Heart-Brain Connection Consortium
» Voorzitter Special Interest Group on Reproducibility and Open Science, DEMON Network, International Network on AI in Dementia, Exeter/UK
» Organisator van een aantal Grand Challenges op het gebied van machine learning voor dementie (CADDementieTAPOLE, en het TADPOLE-SHARE initiatief voor het delen van voorspellingsalgoritmes)
» Reviewer voor wetenschappelijke tijdschriften zoals NeuroImage, Brain, Medical Image
_______________________________________________________________________________
Onderzoeksprojecten » ImProVas
» Heart-Brain Connection Crossroads
» Parelsnoer
» Medical Delta Diagnostics 3.0: Dementia and Stroke
» Netherlands Consortium of Dementia Cohorts
_______________________________________________________________________________
Subsidies/awards » Young eScientist Award 2018 - the Netherlands eScience Center
» Publiek-Private Samenwerkingsbeurs – Hartstichting
Over mij
Ik leid een onderzoeksgroep op het gebied van de analyse van hersenscans en het gebruik van machine learning hiervoor, met als doel om de ziekteprocessen bij dementie beter in kaart te brengen. Ik onderzoek hoe deze computertechnieken optimaal kunnen leren van medische gegevens, echt kunnen bijdragen aan een tijdige diagnose bij mensen met dementie, beter inzicht in het ziekteproces van een specifiek persoon, en uiteindelijk aan betere zorg voor patiënten door artsen.
Uitgelichte publicaties
✔ Bron, E. E., et al. (2021). Cross-Cohort Generalizability of Deep and Conventional Machine Learning for MRI-based Diagnosis and Prediction of Alzheimer’s Disease. Neuroimage Clinical, 31(June).
✔ Bron, E. E., et al. (2015). Standardized evaluation of algorithms for computer-aided diagnosis of dementia based on structural MRI: The CADDementia challenge. Neuroimage, 111, 562–579.
✔ Li, B., ..., & Bron, E. E. (2021). Longitudinal diffusion mri analysis using segis-net: a single-step deep-learning framework for simultaneous segmentation and registration. 235:118004
✔ van der Ende, E. L., Bron, E. E., et al. (2021). A data-driven disease progression model of fluid biomarkers in genetic frontotemporal dementia. Brain, 2–35.
✔ Venkatraghavan, V., … Bron, E. E. (2021). Analyzing the effect of APOE on Alzheimer’s disease progression using an event-based model for stratified populations. NeuroImage, 227:117646